beadarraySNP

DOI:10.18129 / B9.bioc.beadarraySNP

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅beadarraySNP。

标准化和报告的Illumina公司SNP珠阵列

Bioconductor版本:3.8

导入数据从Illumina公司SNP和执行拷贝数的计算和实验报告。

作者:1月东

维护人员:1月东< j。东在lumc.nl >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“beadarraySNP”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“beadarraySNP”)

PDF	R脚本	beadarraySNP.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation,DataImport,GeneticVariability,预处理,单核苷酸多态性,软件,TwoChannel
版本	1.48.0
Bioconductor自	BioC 1.9 (r - 2.4)(12.5年)
许可证	GPL-2
取决于	方法,Biobase(> = 2.14),quantsmooth
进口
链接
建议	aCGH,affy,limma,snapCGH,beadarray,DNAcopy
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	beadarraySNP_1.48.0.tar.gz
Windows二进制	beadarraySNP_1.48.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	beadarraySNP_1.48.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beadarraySNP
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ beadarraySNP
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/beadarraySNP/
包下载报告	下载数据