舞会礼服

doi:10.18129/b9.bioc.ballgown

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅舞会礼服

柔性,同工级差分表达分析

生物导体版本:3.8

用于组装转录组的统计分析工具,包括灵活的差分表达分析,转录本结构的可视化以及组装转录本与注释的匹配。

作者:Jack Fu [Aut],Alyssa C. Frazee [Aut,Cre],Leonardo Collado-Torres [Aut],Andrew E. Jaffe [Aut],Jeffrey T. Leek [Aut,THS]

维护者:JHSPH.edu> Jack Fu

引用(从r内,输入引用(“ Ballgown”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ballgown”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Ballgown”)

html R脚本 柔性同工级差异表达分析与球门
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,免疫学,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,软件,,,,统计信息
版本 2.14.1
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(4。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.1.1),方法
进口 基因组机(> = 1.17.25),iranges(> = 1.99.22),S4VECTORS(> = 0.9.39),rcolorbrewer,花键,SVA,,,,林玛,,,,rtracklayer(> = 1.29.25),生物酶(> = 2.25.0),GenomeInfodB
链接
建议 测试,,,,尼特
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/alyssafrazee/ballgown/issues
取决于我
进口我 rnaseqr
建议我 聚酯纤维,,,,方差分区
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Ballgown_2.14.1.tar.gz
Windows二进制 ballgown_2.14.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Ballgown_2.14.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ballgown
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/滚珠
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ballgown/
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