Annmap
doi：10.18129/b9.bioc.annmap
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅Annmap。
基因组注释和可视化软件包与Affymetrix阵列和NGS分析有关。
生物导体版本：3.8
AnnMap提供了Affymetrix外显子阵列和基于坐标的查询的注释映射，以支持深层测序数据分析。数据库访问隐藏在API后面，该功能提供了一组函数，例如GenesInrange（），Genetoexon（），Exondetails（）等。还提供了用于绘制基因体系结构和BAM文件数据的功能。基础数据来自Ensembl。
作者：蒂姆·耶茨（Tim Yates）
维护者：克里斯·沃思（Chris Wirth）
引用（从r内，输入引用（“ Annmap”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ annmap”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ AnnMap”）
| ANNMAP安装指令 | ||
| Annmap底漆 | ||
| Annmap食谱 | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 注解，，，，微阵列，，，，Onechannel，，，，报告写作，，，，软件，，，，转录，，，，可视化 |
| 版本 | 1.24.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.11（R-2.15）（6。5年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | R（> = 2.15.0），方法，基因组机 |
| 进口 | DBI，，，，rmysql（> = 0.6-0），消化，，，，生物酶， 网格，格子，，，，rsamtools，，，，GeneFilter，，，，iranges，，，，生物基因 |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，rjson，，，，GVIZ |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://annmap.cruk.manchester.ac.uk |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | annmap_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | annmap_1.24.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annmap |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/annmap |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/annmap/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
