高山

DOI:10.18129 / B9.bioc.alpine

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅高山。

高山

Bioconductor版本:3.8

片段序列偏差建模和修正RNA-seq转录丰度估计。

作者:迈克尔·爱,拉斐尔•伊

维修工:迈克尔爱< michaelisaiahlove gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“高山”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“高山”)

HTML	R脚本	高山
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,BatchEffect,报道,DifferentialSplicing,GeneExpression,归一化,质量控制,RNASeq,测序,软件,转录,可视化
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(2.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.3)
进口	Biostrings,IRanges,GenomicRanges,GenomicAlignments,Rsamtools,SummarizedExperiment,GenomicFeatures,speedglm样条函数,图,RBGL,stringr、数据、方法、图形GenomeInfoDb,S4Vectors
链接
建议	knitr,testthat,alpineData,rtracklayer,ensembldb,BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38,RColorBrewer
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	alpine_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	alpine_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	alpine_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alpine
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/高山
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/alpine/
包下载报告	下载数据