Affyilm

doi:10.18129/b9.bioc.affyilm

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅Affyilm

背景减法的线性模型和langmuir等温线

生物导体版本:3.8

Affyilm是一种预处理工具,可估计Affymetrix基因芯片的基因表达水平。在代表Langmuir模型计算浓度之前,采用物理化学的输入来减去强度。

作者:K。Myriam Kroll,Fabrice Berger,Gerard Barkema,Enrico Carlon

维护者:Myriam Kroll和Fabrice Berger

引用(从r内,输入引用(“ Affyilm”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ affyilm”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Affyilm”)

PDF R脚本 Affyilm1.3.0
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,软件
版本 1.34.0
在生物导体中 Bioc 2.6(R-2.11)(9年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 2.10.0),方法,GCRMA
进口 affxparser(> = 1.16.0),副词,图形,生物酶
链接
建议 AffymetrixDatatestFiles,,,,hgfocusprobe
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Affyilm_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 affyilm_1.34.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) Affyilm_1.34.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affyilm
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/affyilm
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/affyilm/
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