该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅Affyilm。
生物导体版本:3.8
Affyilm是一种预处理工具,可估计Affymetrix基因芯片的基因表达水平。在代表Langmuir模型计算浓度之前,采用物理化学的输入来减去强度。
作者:K。Myriam Kroll,Fabrice Berger,Gerard Barkema,Enrico Carlon
维护者:Myriam Kroll和Fabrice Berger
引用(从r内,输入引用(“ Affyilm”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ affyilm”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Affyilm”)
R脚本 | Affyilm1.3.0 | |
参考手册 |
生物浏览 | 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,软件 |
版本 | 1.34.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.6(R-2.11)(9年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 2.10.0),方法,GCRMA |
进口 | affxparser(> = 1.16.0),副词,图形,生物酶 |
链接 | |
建议 | AffymetrixDatatestFiles,,,,hgfocusprobe |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Affyilm_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | affyilm_1.34.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Affyilm_1.34.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affyilm |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/affyilm |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/affyilm/ |
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