affxparser

DOI:10.18129 / B9.bioc.affxparser

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见affxparser．

Affymetrix文件解析SDK

Bioconductor版本:3.8

用于解析Affymetrix文件的包(CDF, CEL, CHP, BPMAP, BAR)。它使用Affymetrix的Fusion SDK提供了快速和内存高效解析Affymetrix文件的方法。支持基于ASCII和二进制的文件。目前，有读取芯片定义文件(CDF)和单元强度文件(CEL)的方法。这些文件可以全部读取，也可以部分读取。例如，可以非常快速地从一组CEL文件中提取来自几个探测集的探测信号到一个方便的列表结构中。

作者:Henrik Bengtsson [aut]， James Bullard [aut]， Robert Gentleman [ctb]， Kasper Daniel Hansen [aut, cre]， Jim Hester [ctb]， Martin Morgan [ctb]

维护者:Kasper Daniel Hansen

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("affxparser")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，基础设施，微阵列，OneChannel，ProprietaryPlatforms，软件
版本	1.54.0
在Bioconductor	BioC 1.7 (R-2.2)(13.5年)
许可证	LGPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.14.0)
进口
链接
建议	R.oo(> = 1.22.0),R.utils(> = 2.7.0),AffymetrixDataTestFiles
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/HenrikBengtsson/affxparser
BugReports	https://github.com/HenrikBengtsson/affxparser/issues
全靠我	斜体，pdInfoBuilder，rMAT，斯塔尔
进口我	affyILM，cn.farms，crossmeta，EventPointer，GeneRegionScan，斜体，益生元，rMAT
建议我	锡
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	affxparser_1.54.0.tar.gz
Windows二进制	affxparser_1.54.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	affxparser_1.54.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affxparser
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affxparser
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/affxparser/
软件包下载报告	下载数据