adsplit

doi:10.18129/b9.bioc.adsplit

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅adsplit

注释驱动的聚类

生物导体版本:3.8

该软件包根据功能注释实现微阵列基因表达谱的聚类。对于每个术语基因,都注释为分解为两个子类,并确定支持基因集的重要性。

作者:Claudio Lottaz,Joern Toedling

维护者:claudio lottaz

引用(从r内,输入引用(“ adsplit”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ adsplit”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ adsplit”)

PDF R脚本 注释驱动的聚类
PDF 参考手册

细节

生物浏览 聚类,,,,微阵列,,,,软件
版本 1.52.0
在生物导体中 Bioc 1.8(R-2.3)(13年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.1.0),方法(> = 2.1.0)
进口 AnnotationDbi,,,,生物酶(> = 1.5.12),(> = 1.9.1),go.db(> = 1.8.1),图形,grdevices,kegg.db(> = 1.8.1),方法,多检验(> = 1.6.0),Stats(> = 2.1.0)
链接
建议 golubeset(> = 1.0),VSN(> = 1.5.0),Hu6800.db(> = 1.8.1)
系统要求
增强
URL http://compdiag.molgen.mpg.de/software/index.shtml
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 adsplit_1.52.0.tar.gz
Windows二进制 adsplit_1.52.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) adsplit_1.52.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/adsplit
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/adsplit
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/adsplit/
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