这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见VanillaICE.
Bioconductor版本:3.8
用于表征高通量SNP阵列中染色体改变的隐马尔科夫模型。
作者:Robert Scharpf
维护者:Robert Scharpf
引文(从R内,输入引用(“VanillaICE”)
):
要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("VanillaICE")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“VanillaICE”)
R脚本 | crlmmDownstream | |
R脚本 | VanillaICE装饰图案 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CopyNumberVariation,软件 |
版本 | 1.44.0 |
在Bioconductor | BioC 2.1 (R-2.6)(11.5年) |
许可证 | LGPL-2 |
取决于 | R (>= 3.0.0),BiocGenerics(> = 0.13.6),GenomicRanges(> = 1.27.6),SummarizedExperiment(> = 1.5.3)更正 |
进口 | Biobase,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges(> = 1.14.0),oligoClasses(> = 1.31.1),foreach,matrixStats,data.table、网格晶格、方法、GenomeInfoDb(> = 1.11.4),crlmm,工具,统计,utils,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 |
链接 | |
建议 | RUnit,SNPchip,human610quadv1bCrlmm,ArrayTV |
SystemRequirements | |
增强了 | doMC,doMPI,doSNOW,doParallel,doRedis |
URL | |
全靠我 | MinimumDistance |
进口我 | |
建议我 | CNPBayes,oligoClasses |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | VanillaICE_1.44.0.tar.gz |
Windows二进制 | VanillaICE_1.44.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | VanillaICE_1.44.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/VanillaICE |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/VanillaICE |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/VanillaICE/ |
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