TSSI

doi:10.18129/b9.bioc.tssi

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅TSSI

转录开始站点标识

生物导体版本:3.8

在高通量测序数据中识别并标准化转录起始站点。

作者:朱利安·盖林(Julian Gehring),克莱门斯·克鲁兹(Clemens Kreutz)

维护者:julian gehring

引用(从r内,输入引用(“ TSSI”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ tssi”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ TSSI”)

PDF R脚本 TSSI软件包简介:转录起始站点的识别
PDF 参考手册

细节

生物浏览 遗传学,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.28.0
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(7。5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 2.13.2)
进口 方法,生物基因(> = 0.3.2),S4VECTORS,,,,HMISC,,,,Minqa,统计生物酶(> = 0.3.2),plyr,,,,iranges
链接
建议 rtracklayer
系统要求
增强 平行
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 tssi_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 tssi_1.28.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) tssi_1.28.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tssi
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/tssi
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/tssi/
软件包下载报告 下载统计

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