该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅tfarm。
生物导体版本:3.8
它在特定的基因组区域中搜索了转录因子与转录因子目标的相关关联。它还允许评估关联规则中转录因子(和转录因子的组合)的重要性指数分布。
作者:Liuba Nausicaa Martino,Alice Parodi,Gaia Ceddia,Piercesare Secchi,Stefano Campaner,Marco Masseroli
维护者:liuba nausicaa martino
引用(从r内,输入引用(“ Tfarm”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ tfarm”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Tfarm”)
R脚本 | 转录因子关联规则矿工 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 生物问题,,,,基础设施,,,,软件,,,,统计信息,,,,转录 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.6(R-3.4)(1。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.4) |
进口 | 阿鲁斯,,,,字段,,,,基因组机,图形,grdevices,Stringr,方法,统计 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,plyr |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | tfarm_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | tfarm_1.4.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | tfarm_1.4.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tfarm |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/tfarm |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/tfarm/ |
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