SpeCond

DOI:10.18129 / B9.bioc.SpeCond

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见SpeCond．

从表达数据中检测特定条件

Bioconductor版本:3.8

该包执行基因表达数据分析，以检测特定条件的基因。这些基因在少数情况下显著上调或下调。它通过将正态分布的混合物拟合到表达式值来实现这一点。条件可以是环境条件，不同的组织，器官或任何其他你想比较基因表达的来源。

作者:Florence Cavalli

维护者:Florence Cavalli < Florence at ebi.ac.uk>

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("SpeCond")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SpeCond”)

PDF	R脚本	SpeCond
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类，DifferentialExpression，微阵列，MultipleComparison，ReportWriting，软件
版本	1.36.0
在Bioconductor	BioC 2.5 (R-2.10)(9.5年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	R (>= 2.10.0)，mclust(> = 3.3.1),Biobase(> = 1.15.13),字段，hwriter(> = 1.1),RColorBrewer、方法
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
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全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SpeCond_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	SpeCond_1.36.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	SpeCond_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SpeCond
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SpeCond
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SpeCond/
软件包下载报告	下载数据