SpeCond

DOI:10.18129 / B9.bioc.SpeCond

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见SpeCond

从表达数据中检测特定条件

Bioconductor版本:3.8

该包执行基因表达数据分析,以检测特定条件的基因。这些基因在少数情况下显著上调或下调。它通过将正态分布的混合物拟合到表达式值来实现这一点。条件可以是环境条件,不同的组织,器官或任何其他你想比较基因表达的来源。

作者:Florence Cavalli

维护者:Florence Cavalli < Florence at ebi.ac.uk>

引文(从R内,输入引用(“SpeCond”)):

安装

要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("SpeCond")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“SpeCond”)

PDF R脚本 SpeCond
PDF 参考手册

细节

biocViews 聚类DifferentialExpression微阵列MultipleComparisonReportWriting软件
版本 1.36.0
在Bioconductor BioC 2.5 (R-2.10)(9.5年)
许可证 LGPL (> = 2)
取决于 R (>= 2.10.0),mclust(> = 3.3.1),Biobase(> = 1.15.13),字段hwriter(> = 1.1),RColorBrewer、方法
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 SpeCond_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 SpeCond_1.36.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) SpeCond_1.36.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SpeCond
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SpeCond
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SpeCond/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网