这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SimBindProfiles。
Bioconductor版本:3.8
SimBindProfiles识别常见的和独特的基因组花砖阵列数据绑定的地区。这个包不依赖于峰值的召唤,但直接对比绑定配置文件处理在同一阵列平台。它实现了一个简单的阈值的方法,从而使一般检索和不同地区之间的数据集以及补偿和增加绑定的事件。
作者:贝蒂娜费舍尔,恩里科•费列罗,罗伯特•Stojnic史蒂夫·罗素
维修工:贝蒂娜费舍尔< bef22在cam.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“SimBindProfiles”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SimBindProfiles”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“SimBindProfiles”)
R脚本 | SimBindProfiles:类似绑定配置文件,识别常见的和独特的区域数组基因组花砖数组数据 | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,软件 |
版本 | 1.20.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.13 (r - 3.0)(5.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R(> = 2.10),方法,林格 |
进口 | limma,mclust,Biobase |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | SimBindProfiles_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | SimBindProfiles_1.20.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | SimBindProfiles_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SimBindProfiles |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SimBindProfiles |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SimBindProfiles/ |
包下载报告 | 下载数据 |