Seqarray
doi：10.18129/b9.bioc.seqarray
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅Seqarray。
大规模全基因组序列变体的数据管理
生物导体版本：3.8
大规模全基因组测序变体的数据管理具有数千个个体：基因型数据（例如，SNV，Indels和结构变化调用）和Seqarray文件中的注释以有效的和压缩的方式存储，并以有效的数据访问方式存储使用R编程语言。
作者：Xiuwen Zheng [AUT，CRE]，Stephanie Gogarten [AUT]，David Levine [CTB]，Cathy Laurie [CTB]
维护者：Xiuwen Zheng
引用（从r内，输入引用（“ seqarray”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ seqarray”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Seqarray”）
| html | R脚本 | R集成 |
| html | R脚本 | seqarray数据格式和访问 |
| html | seqarray概述 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | datarepresentation，，，，遗传学，，，，基础设施，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.22.6 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（6年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.5.0），GDSFMT（> = 1.18.0） |
| 进口 | 方法，并行，iranges，，，，基因组机，，，，GenomeInfodB，，，，生物弦，，，，S4VECTORS |
| 链接 | GDSFMT |
| 建议 | 生物酶，，，，生物基因，，，，生物比较，，，，运行，，，，RCPP，，，，Snprelate，，，，消化，，，，蜡笔，，，，尼特，，，，rsamtools，，，，变体 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://github.com/zhengxwen/seqarray |
| BugReports | http://github.com/zhengxwen/seqarray/issues |
| 取决于我 | Seqvartools |
| 进口我 | GDSARRAY，，，，创世纪 |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | seqarray_1.22.6.tar.gz |
| Windows二进制 | seqarray_1.22.6.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | seqarray_1.22.6.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqarray |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/seqarray |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/seqarray/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
