Scale4C

DOI:10.18129 / B9.bioc.Scale4C

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Scale4C。

Scale4C: R / Bioconductor包4 c-seq数据的尺度空间的转换

Bioconductor版本:3.8

Scale4C R / Bioconductor包4 c-seq数据的尺度空间变换和可视化。尺度空间的转换是一种多尺度可视化技术将二维信号(例如4 c-seq读取基因选择的间隔)成一个多边形密度在尺度空间(2 d基因组位置x比例因子)通过应用不同的平滑内核(高斯,随着σ)。这种转变使得探测的数据的分析和比较与其他样品的结构。

作者:卡罗琳沃尔特

维修工:卡罗琳沃尔特<卡罗琳。沃尔特在uni-muenster.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Scale4C”)

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文档

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PDF	R脚本	Scale4C: R / Bioconductor包4 c-seq数据的尺度空间的转换
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文本		新闻

细节

biocViews	报道,DataImport,质量控制,测序,软件,可视化
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(1.5年)
许可证	LGPL-3
取决于	R (> = 3.4),奶昔,GenomicRanges,IRanges,SummarizedExperiment
进口	方法、grDevices图形,跑龙套
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Scale4C_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	Scale4C_1.4.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	Scale4C_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Scale4C
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Scale4C
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Scale4C/
包下载报告	下载数据