分裂

DOI:10.18129 / B9.bioc.SPLINTER

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅分裂。

拼接的成绩单翻译

Bioconductor版本:3.8

分裂提供了工具来分析可变剪接网站,解释结果序列信息的基础上,选择并设计引物网站validiation,给下游事件的可视化表示指导实验。

作者:戴安娜低

维护人员:戴安娜低< dlow imcb.a-star.edu.sg >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“分裂”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“分裂”)

PDF	R脚本	分裂
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,软件,可视化
版本	1.8.1
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(2.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.4.0), grDevices,统计数据
进口	图形,ggplot2,seqLogo,Biostrings,biomaRt,GenomicAlignments,GenomicRanges,GenomicFeatures,Gviz,IRanges,S4Vectors,GenomeInfoDb跑龙套,plyr,stringr、方法、BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,googleVis
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SPLINTER_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	SPLINTER_1.8.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	SPLINTER_1.8.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPLINTER
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/分裂
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SPLINTER/
包下载报告	下载数据