肋骨蛋白
doi：10.18129/b9.bioc.Ribopofiling
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅肋骨蛋白。
核糖体分析数据分析：从BAM到数据表示和解释
生物导体版本：3.8
从BAM文件开始，此软件包提供了质量评估，读取启动位置重新校准的必要功能频率和覆盖范围评估，密码子覆盖范围的主要成分分析。
作者：Alexandra Popa
维护者：a。popa
引用（从r内，输入引用（“肋骨蛋白”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ riboprofiling”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Riboprofiling”）
| R脚本 | 用“ Riboprofiling”软件包分析Ribo-Seq数据 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 结盟，，，，覆盖范围，，，，委托人，，，，QualityControl，，，，核糖，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.2（R-3.2）（3。5年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.2.2），生物弦 |
| 进口 | 生物基因，，，，GenomeInfodB，，，，基因组机，，，，iranges，，，，RESHAPE2，，，，GenomicFeatures， 网格，plyr，，，，S4VECTORS，，，，基因组签名，，，，GGPLOT2，，，，GGBIO，，，，rsamtools，，，，rtracklayer，，，，Data.Table，，，，SQLDF |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，生物使用，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，测试，，，，总结性特征 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | riboprofiling_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | riboprofiling_1.12.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | riboprofiling_1.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/riboprofiling |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/ruboprofling |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/riboprofling/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
