RankProd

DOI:10.18129 / B9.bioc.RankProd

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见RankProd

鉴别差异表达基因的秩积法及其在元分析中的应用

Bioconductor版本:3.8

基于错误预测估计百分比(pfp)识别差异表达(上调或下调)基因的非参数方法。该方法可以组合来自不同来源的数据集(元分析),以增加识别的能力。

作者:Francesco Del Carratore < Francesco .delcarratore at postgraduate .manchester.ac。uk>, Andris Jankevics < Andris。洪方欣, Ben Wittner , Rainer Breitling < Rainer。百年灵曼彻斯特。ac。Florian Battke < Battke at informatik.uni-tuebingen.de>

维护者:Francesco Del Carratore

引文(从R内,输入引用(“RankProd”)):

安装

要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RankProd”)

PDF R脚本 RankProd教程
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionGeneSignalingLipidomics代谢组学微阵列蛋白质组学ResearchField软件StatisticalMethodSystemsBiology
版本 3.8.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 14年)
许可证 文件许可
取决于 R(>= 3.2.1),统计,方法,Rmpfrgmp
进口 图形
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增强了
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全靠我 RNAithertRanslatome
进口我 HTSanalyzeRsynlet
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 RankProd_3.8.0.tar.gz
Windows二进制 RankProd_3.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) RankProd_3.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RankProd
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RankProd
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RankProd/
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