该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅rdavidwebservice。
生物导体版本:3.8
从数据库中检索数据的工具,用于注释,可视化和集成发现(David),使用Web服务到R对象中。该软件包提供了David网站的主要功能,包括:i)用户友好的连接到上传基因/背景列表/s,更改基因/背景位置,选择当前Specie/s,选择注释等。II)提交基因列表的报告,注释类别摘要,基因/项簇,功能注释图,功能注释表
作者:Cristobal Fresno和Elmer A. Fernandez
维护者:cristobal fresno
引用(从r内,输入引用(“ rdavidwebservice”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rdavidwebservice”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ rdavidwebservice”)
R脚本 | rdavidwebservice:David的多功能R接口 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 差异性,,,,GraphandNetwork,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.20.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(5。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | R(> = 2.14.1),方法,图形,,,,gostats,,,,GGPLOT2 |
进口 | 类别,,,,go.db,,,,rbgl,,,,rjava |
链接 | |
建议 | rgraphviz |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.bdmg.com.arhttp://david.abcc.ncifcrf.gov/ |
取决于我 | compgo |
进口我 | |
建议我 | fgnet,,,,Intramirexplorer |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rdavidwebservice_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | rdavidwebservice_1.20.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | rdavidwebservice_1.20.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rdavidwebservice |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rdavidwebservice |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rdavidwebservice/ |
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