rdavidwebservice

doi:10.18129/b9.bioc.rdavidwebservice

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅rdavidwebservice

使用Web Services API将数据从David检索到R对象的R软件包。

生物导体版本:3.8

从数据库中检索数据的工具,用于注释,可视化和集成发现(David),使用Web服务到R对象中。该软件包提供了David网站的主要功能,包括:i)用户友好的连接到上传基因/背景列表/s,更改基因/背景位置,选择当前Specie/s,选择注释等。II)提交基因列表的报告,注释类别摘要,基因/项簇,功能注释图,功能注释表

作者:Cristobal Fresno和Elmer A. Fernandez

维护者:cristobal fresno

引用(从r内,输入引用(“ rdavidwebservice”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rdavidwebservice”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ rdavidwebservice”)

PDF R脚本 rdavidwebservice:David的多功能R接口
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,GraphandNetwork,,,,软件,,,,可视化
版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(5。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 2.14.1),方法,图形,,,,gostats,,,,GGPLOT2
进口 类别,,,,go.db,,,,rbgl,,,,rjava
链接
建议 rgraphviz
系统要求
增强
URL http://www.bdmg.com.arhttp://david.abcc.ncifcrf.gov/
取决于我 compgo
进口我
建议我 fgnet,,,,Intramirexplorer
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rdavidwebservice_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 rdavidwebservice_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) rdavidwebservice_1.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rdavidwebservice
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rdavidwebservice
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rdavidwebservice/
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