平
DOI:10.18129 / B9.bioc.PING
这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅平。
核小体定位的概率推理MNase-based或用短内容数据
Bioconductor版本:3.8
使用一个经验贝叶斯概率推理的ChIP-Seq混合模型的方法。
作者:Xuekui张< xuezhang jhsph.edu >,拉斐尔在stat.ubc Gottardo <拉斐尔。ca >, Sangsoon吸引< swoo fhcrc.org >
维护人员:升Sauteraud < rsautera fhcrc.org >
从内部引用(R,回车引用(“平”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“平”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“平”)
| R脚本 | 萍用户指南 | |
| R脚本 | 使用PING paired-end测序数据 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 聚类,测序,软件,StatisticalMethod,可视化 |
| 版本 | 2.26.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.10 (r - 2.15)(7年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 2.15.0),chipseq,IRanges,GenomicRanges |
| 进口 | 方法,图片、图形grDevices,统计数据,Gviz,食品及药物管理局,BSgenomestats4,BiocGenerics,IRanges,S4Vectors |
| 链接 | |
| 建议 | 平行,ShortRead,rtracklayer |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | PING_2.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | PING_2.26.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | PING_2.26.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PING |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/平 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PING/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
