DOI:10.18129 / B9.bioc.PING

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅

核小体定位的概率推理MNase-based或用短内容数据

Bioconductor版本:3.8

使用一个经验贝叶斯概率推理的ChIP-Seq混合模型的方法。

作者:Xuekui张< xuezhang jhsph.edu >,拉斐尔在stat.ubc Gottardo <拉斐尔。ca >, Sangsoon吸引< swoo fhcrc.org >

维护人员:升Sauteraud < rsautera fhcrc.org >

从内部引用(R,回车引用(“平”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“平”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“平”)

PDF R脚本 萍用户指南
PDF R脚本 使用PING paired-end测序数据
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类,测序,软件,StatisticalMethod,可视化
版本 2.26.0
Bioconductor自 BioC 2.10 (r - 2.15)(7年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.15.0),chipseq,IRanges,GenomicRanges
进口 方法,图片、图形grDevices,统计数据,Gviz,食品及药物管理局,BSgenomestats4,BiocGenerics,IRanges,S4Vectors
链接
建议 平行,ShortRead,rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 PING_2.26.0.tar.gz
Windows二进制 PING_2.26.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) PING_2.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PING
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/平
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PING/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网