PGSEA

doi:10.18129/b9.bioc.pgsea

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅PGSEA

参数基因集富集分析

生物导体版本:3.8

基因集富集的参数分析

作者:kyle furge 和karl dykema

维护者:karl dykema

引用(从r内,输入引用(“ PGSEA”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pgsea”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ PGSEA”)

PDF R脚本 Howto:PGSEA
PDF R脚本 Howto:PGSEA示例工作流程
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,软件
版本 1.56.0
在生物导体中 Bioc 2.0(R-2.5)(12年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 2.10),go.db,,,,kegg.db,,,,AnnotationDbi,,,,安菲, 方法,生物酶(> = 2.5.5)
进口
链接
建议 gseabase,,,,地球,,,,org.hs.eg.db,,,,HGU95AV2.DB,,,,林玛
系统要求
增强
URL
取决于我 geneexpressionsignation
进口我
建议我 GSKB
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 pgsea_1.56.0.tar.gz
Windows二进制 pgsea_1.56.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) pgsea_1.56.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pgsea
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pgsea
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/pgsea/
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