padog

doi:10.18129/b9.bioc.padog

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅padog

途径分析,重叠基因(PADOG)的下降加权

生物导体版本:3.8

该软件包实现了称为PADOG的通用基因集分析方法,该方法淡化了基因的重要性,而基因通常会累积要分析的基因集。该软件包还使用KeggdzPathwaysGeo软件包的24个公共数据集为基因集分析方法提供了基准测试。

作者:adi laurentiu tarca ;zhonghui xu

维护者:Adi Laurentiu Tarca

引用(从r内,输入引用(“ Padog”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ padog”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Padog”)

PDF R脚本 padog
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,Onechannel,,,,软件,,,,两通道
版本 1.24.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(6。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.0.0),keggdzpathwaysgeo, 方法,生物酶
进口 林玛,,,,AnnotationDbi,,,,GSA,,,,foreach,,,,Dorng,,,,hgu133plus2.db,,,,HGU133A.DB,,,,kegg.db,,,,nlme
链接
建议 多帕尔, 平行
系统要求
增强
URL
取决于我 blma
进口我 Egsea
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 padog_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 padog_1.24.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) padog_1.24.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/padog
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/padog
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/padog/
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