OrganismDbi

DOI:10.18129 / B9.bioc.OrganismDbi

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见OrganismDbi．

软件，使不同的数据库包的顺畅接口

Bioconductor版本:3.8

这个包为几个注释包提供了一个简单的统一接口，每个注释包都有自己的模式，因为每个注释包都实现了一个选择方法。

作者:Marc Carlson, Hervé Pagès, Martin Morgan, Valerie Obenchain

维护者:Biocore数据团队< bioconductor.org>维护者

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("有机体dbi ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“OrganismDbi”)

PDF	R脚本	OrganismDbi:注释包的元框架
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，基础设施，软件
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.14.0)，方法，BiocGenerics(> = 0.15.10),AnnotationDbi(> = 1.33.15),GenomicFeatures(> = 1.23.31)
进口	Biobase，BiocManager，GenomicRanges(> = 1.31.13),图，IRanges，RBGL，DBI，S4Vectors(>= 0.9.25)， stats
链接
建议	Homo.sapiens，Rattus.norvegicus，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，AnnotationHub，FDb.UCSC.tRNAs，rtracklayer，biomaRt，RUnit，RMariaDB
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	Homo.sapiens，Mus.musculus，Rattus.norvegicus
进口我	AnnotationHubData，epivizrData，ggbio，gpart软件
建议我	ChIPpeakAnno，epivizrStandalone
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	OrganismDbi_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	OrganismDbi_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	OrganismDbi_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OrganismDbi
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/OrganismDbi
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/OrganismDbi/
软件包下载报告	下载数据