该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅有机体。
生物导体版本:3.8
该软件包提供了生物通用器“注释”资源的替代接口,尤其是“ org”软件包(例如org.hs.eg.db)的基因标识符映射功能和“ TXDB”软件包的基因组坐标功能(例如,,TXDB.HSAPIENS.UCSC.HG38.NOWNE)。
作者:Martin Morgan [AUT,CRE],Yubo Cheng [CTB]
维护者:Martin Morgan
引用(从r内,输入引用(“有机体.dplyr”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ asymism.dplyr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“有机体.dplyr”)
html | R脚本 | 有机体 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 注解,,,,基因数,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(2年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.4),dplyr(> = 0.7.0),AnnotationFilter(> = 1.1.3) |
进口 | rsqlite,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,iranges,,,,基因组机,,,,GenomicFeatures,,,,AnnotationDbi,方法,工具,utils,Biocfilecache,,,,DBI,,,,dbplyr |
链接 | |
建议 | org.hs.eg.db,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,org.mm.eg.db,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm10.ensgene,,,,测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,GGPLOT2 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | 注解 |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | 有机体dplyr_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | 有机体。dplyr_1.10.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | 有机体.dplyr_1.10.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/organism.dplyr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/有机体。 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/organism.dplyr/ |
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