OMICSPCA

doi：10.18129/b9.bioc.omicspca

该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅OMICSPCA。

用于定量整合和分析多种OMICS分析的R包装

生物导体版本：3.8

OMICSPCA是一种分析管道，旨在整合对各种受试者（例如细胞系，个体），治疗方法（例如疾病/对照）或时间点进行的多功能实验，并从各种角度和角度分析此类综合数据。在其核心OMICSPCA中，使用主组件分析（PCA）来整合来自各种来源的多组学实验，因此具有通过使用插入数据作为代表来超越数据不足问题的能力。OMICSPCA可用于各种应用，包括分析各种样本 /个体 /时间点上OMICS分析的总体分布；按用户定义的条件分组测定；识别变异源，测定法，变量或个体之间的相似性/差异。

作者：Subhadeep Das [AUT，CRE]，Susteeta Tripathy博士[CTB]

维护者：subhadeep das

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ omicspca”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ OmicsPCA”）

html	R脚本	OMICSPCA
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	生物问题，，，，生物医学信息学，，，，聚类，，，，datarepresentation，，，，维度，，，，表观遗传学，，，，表观遗传学，，，，功能基因组学，，，，GUI，，，，遗传因素，，，，免疫学，，，，多重组合，，，，委托人，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录，，，，可视化，，，，工作流程
版本	1.0.1
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（0.5岁）
执照	GPL-3
要看	r（> = 3.5.0），OMICSPCADATA
进口	Helloranges，，，，FPC，统计多亚sayExexperiment，，，，pdftools，方法，grdevices，utils，clvalid，，，，nbclust，，，，牛仔图，，，，rmarkDown，，，，KableExtra，，，，rtracklayer，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，RESHAPE2，，，，GGPLOT2，，，，事实，，，，RGL，，，，Corrplot，，，，大量的，图形，Factominer，，，，表演，，，，花花公子，，，，Data.Table，，，，簇，，，，魔术
链接
建议	尼特，，，，运行，，，，生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	OMICSPCA_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	OMICSPCA_1.0.1.ZIP
Mac OS X 10.11（El Capitan）	OMICSPCA_1.0.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/omicspca
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/omicspca
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/omicspca/
软件包下载报告	下载统计