NanostringQccpro
doi：10.18129/b9.bioc.nanostringqccpro
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅NanostringQccpro。
纳米串mRNA基因表达数据的质量指标和数据处理方法
生物导体版本：3.8
NanoStringQCPRO提供了一组质量指标，可用于评估纳米串mRNA基因表达数据的质量 - 即确定离群探针和离群样品。它还为该数据提供了不同的背景减法和归一化方法。它输出了标记样品/探针和易于共享的HTML质量控制输出的建议。
作者：dorothee nickles
维护者：Robert Ziman
引用（从r内，输入引用（“ nanostringqcpro”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ nanostringqccpro”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ nanostringqcpro”）
| vignettenanostringqccpro.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 微阵列，，，，正常化，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，报告写作，，，，软件，，，，Mrnamicroarray |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（4年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.2），方法 |
| 进口 | AnnotationDbi（> = 1.26.0），org.hs.eg.db（> = 2.14.0），生物酶（> = 2.24.0），尼特（> = 1.12），NMF（> = 0.20.5），rcolorbrewer（> = 1.0-5），PNG（> = 0.1-7） |
| 链接 | |
| 建议 | roxygen2（> = 4.0.1），测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | nanostringqccpro_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | nanostringqccpro_1.14.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | nanostringqccpro_1.14.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nanostringqccpro |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/nanostringqccpro |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/nanostringqcpro/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
