NOISeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.NOISeq

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅NOISeq。

探索性分析和微分表达式RNA-seq数据

Bioconductor版本:3.8

RNA-seq表达数据分析或其他类似的数据。探索性密谋evualuate饱和,计数分布,每个染色体表达,类型的检测特性,特征长度等。两个实验条件之间的差异表达,没有参数的假设。

作者:索尼娅Tarazona,佩德罗Furio-Tari,玛丽亚Jose Nueda阿尔贝托·费雷尔和安娜Conesa

维护人员:索尼娅Tarazona < starazona在cipf.es >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“NOISeq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“NOISeq”)

PDF	R脚本	NOISeq用户指南
PDF		QCreport.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,可视化
版本	2.26.1
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.13.0)、方法Biobase(> = 2.13.11),样条函数(> = 3.0.1),矩阵(> = 1.2)
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	metaSeq
进口我	CNVPanelizer,metaseqR
建议我	compcodeR
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	NOISeq_2.26.1.tar.gz
Windows二进制	NOISeq_2.26.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	NOISeq_2.26.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NOISeq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NOISeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NOISeq/
包下载报告	下载数据