ngscopy
doi：10.18129/b9.bioc.ngscopy
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅ngscopy。
NGSCOPY：检测下一代测序测序中拷贝数变化
生物导体版本：3.8
NGScopy提供了一个定量呼叫者，用于检测下一代测序（NGS）中的拷贝数变化，包括整个基因组测序（WGS），整个外显子组测序（WES）和目标面板测序（TPS）。可以通过染色体并行将呼叫者在一台计算机上使用多个处理器/内核。
作者：小野Zhao [AUT，CRE，CPH]
维护者：xiaobei zhao
引用（从r内，输入引用（“ ngscopy”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ ngscopy”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ ngscopy”）
| R脚本 | NGSCOPY：检测下一代测序中拷贝数变化（用户指南） | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 库务，，，，dnaseq，，，，Exomeseq，，，，免疫学，，，，测序，，，，软件，，，，目标征服，，，，全媒体 |
| 版本 | 1.16.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（4。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | R（> = 3.1.0） |
| 进口 | 方法，并行，xmisc（> = 0.2.1），rbamtools（> = 2.6.0），更改点（> = 2.1.1） |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，ngscopydata，，，，基因组机 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | ngscopy_1.16.1.tar.gz |
| Windows二进制 | ngscopy_1.16.1.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | ngscopy_1.16.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ngscopy |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/ngscopy |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ngscopy/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
