MinimumDistance

DOI:10.18129 / B9.bioc.MinimumDistance

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见MinimumDistance．

Case-Parent trio中De Novo CNV检测包

Bioconductor版本:3.8

基于高维基因分型平台的三组从头拷贝数变异分析。

作者:Robert B Scharpf和Ingo Ruczinski

维护者:Robert B Scharpf

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MinimumDistance")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MinimumDistance”)

PDF	R脚本	检测病例-亲本三人组中从头拷贝数的改变
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation，微阵列，单核苷酸多态性，软件
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(7年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.3)，VanillaICE(> = 1.31.3)
进口	方法,BiocGenerics，Biobase，S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges(> = 1.17.16),SummarizedExperiment(> = 0.2.0),oligoClasses，DNAcopy，ff，foreach，matrixStats，晶格，data.table，网格，统计，utils
链接
建议	human610quadv1bCrlmm(> = 1.0.3),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，SNPchip，RUnit
SystemRequirements
增强了	雪，doSNOW
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MinimumDistance_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	MinimumDistance_1.26.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MinimumDistance_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MinimumDistance
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MinimumDistance
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MinimumDistance/
软件包下载报告	下载数据