金属底座

DOI:10.18129 / B9.bioc.Metab

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见金属底座

Metab:用于GC-MS生成的代谢组学数据高通量分析的R包。

Bioconductor版本:3.8

metat是一个R包,用于高通量处理由自动质谱反褶积和识别系统(AMDIS)分析的代谢组学数据(http://chemdata.nist.gov/mass-spc/amdis/downloads/)。此外,还进行了统计假设检验(t检验)和方差分析(ANOVA)。这样,Metab大大加快了代谢组学中的数据挖掘过程,并产生了更好的质量结果。Metab使用交互特性开发,允许缺乏R知识的用户欣赏它的功能。

作者:Raphael Aggio

维护者:Raphael Aggio

引文(从R内,输入引用(金属底座)):

安装

要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("Metab")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(金属底座)

PDF R脚本 应用金属底座
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AMDIS这个模型ImmunoOncologyMassSpectrometry代谢组学软件
版本 1.16.1
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(4.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 xcms, r (>= 3.0.1),svDialogs
进口 老鸨
链接
建议 RUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 Metab_1.16.1.tar.gz
Windows二进制 Metab_1.16.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) Metab_1.16.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Metab
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Metab
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Metab/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网