这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见金属底座.
Bioconductor版本:3.8
metat是一个R包,用于高通量处理由自动质谱反褶积和识别系统(AMDIS)分析的代谢组学数据(http://chemdata.nist.gov/mass-spc/amdis/downloads/)。此外,还进行了统计假设检验(t检验)和方差分析(ANOVA)。这样,Metab大大加快了代谢组学中的数据挖掘过程,并产生了更好的质量结果。Metab使用交互特性开发,允许缺乏R知识的用户欣赏它的功能。
作者:Raphael Aggio
维护者:Raphael Aggio
引文(从R内,输入引用(金属底座)
):
要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("Metab")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(金属底座)
R脚本 | 应用金属底座 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | AMDIS,这个模型,ImmunoOncology,MassSpectrometry,代谢组学,软件 |
版本 | 1.16.1 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(4.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | xcms, r (>= 3.0.1),svDialogs |
进口 | 老鸨 |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | Metab_1.16.1.tar.gz |
Windows二进制 | Metab_1.16.1.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | Metab_1.16.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Metab |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Metab |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Metab/ |
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