这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见MTseeker.
Bioconductor版本:3.8
线粒体遗传学的变异分析工具。
作者:Tim Triche [cre, aut], Noor Sohail [aut], Ben Johnson [aut], Tim Vickers [ctb], Azif Zubair [ctb]
维护者:Tim Triche < Tim。Triche在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“MTseeker”)
):
要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MTseeker")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MTseeker”)
超文本标记语言 | R脚本 | MTseeker例子 |
参考手册 |
biocViews | 遗传学,代谢组学,软件,VariantAnnotation |
版本 | 1.0.6 |
在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(0.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | 冬青,S4Vectors,GenomeInfoDb,GenomicAlignments,VariantAnnotation |
进口 | xml2跑龙套,gmapR、方法、IRanges,Biobase,circlize,jsonlite、图形、RsamtoolsgrDevices,Biostrings,rtracklayer,VariantTools,Homo.sapiens,BiocGenerics,GenomicRanges,GenomicFeatures,SummarizedExperiment |
链接 | |
建议 | MTseekerData,BiocStyle,rmarkdown,ggthemes,ggplot2,pkgdown,knitr,rsvg |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | MTseekerData |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MTseeker_1.0.6.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | MTseeker_1.0.6.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MTseeker |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MTseeker |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MTseeker/ |
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