MTseeker

DOI:10.18129 / B9.bioc.MTseeker

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见MTseeker．

用于人类线粒体变异分析的生物导体工具

Bioconductor版本:3.8

线粒体遗传学的变异分析工具。

作者:Tim Triche [cre, aut]， Noor Sohail [aut]， Ben Johnson [aut]， Tim Vickers [ctb]， Azif Zubair [ctb]

维护者:Tim Triche < Tim。Triche在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MTseeker")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MTseeker”)

超文本标记语言	R脚本	MTseeker例子
PDF		参考手册

细节

biocViews	遗传学，代谢组学，软件，VariantAnnotation
版本	1.0.6
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	冬青，S4Vectors，GenomeInfoDb，GenomicAlignments，VariantAnnotation
进口	xml2跑龙套,gmapR、方法、IRanges，Biobase，circlize，jsonlite、图形、RsamtoolsgrDevices,Biostrings，rtracklayer，VariantTools，Homo.sapiens，BiocGenerics，GenomicRanges，GenomicFeatures，SummarizedExperiment
链接
建议	MTseekerData，BiocStyle，rmarkdown，ggthemes，ggplot2，pkgdown，knitr，rsvg
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	MTseekerData
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MTseeker_1.0.6.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MTseeker_1.0.6.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MTseeker
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MTseeker
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MTseeker/
软件包下载报告	下载数据