MTseeker

DOI:10.18129 / B9.bioc.MTseeker

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见MTseeker

用于人类线粒体变异分析的生物导体工具

Bioconductor版本:3.8

线粒体遗传学的变异分析工具。

作者:Tim Triche [cre, aut], Noor Sohail [aut], Ben Johnson [aut], Tim Vickers [ctb], Azif Zubair [ctb]

维护者:Tim Triche < Tim。Triche在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“MTseeker”)):

安装

要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MTseeker")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MTseeker”)

超文本标记语言 R脚本 MTseeker例子
PDF 参考手册

细节

biocViews 遗传学代谢组学软件VariantAnnotation
版本 1.0.6
在Bioconductor BioC 3.8 (R-3.5)(0.5年)
许可证 GPL-3
取决于 冬青S4VectorsGenomeInfoDbGenomicAlignmentsVariantAnnotation
进口 xml2跑龙套,gmapR、方法、IRangesBiobasecirclizejsonlite、图形、RsamtoolsgrDevices,BiostringsrtracklayerVariantToolsHomo.sapiensBiocGenericsGenomicRangesGenomicFeaturesSummarizedExperiment
链接
建议 MTseekerDataBiocStylermarkdownggthemesggplot2pkgdownknitrrsvg
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 MTseekerData
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 MTseeker_1.0.6.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan) MTseeker_1.0.6.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MTseeker
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MTseeker
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MTseeker/
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