mlseq

doi:10.18129/b9.bioc.mlseq

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅mlseq

RNA-seq数据的机器学习界面

生物导体版本:3.8

该软件包应用了几种机器学习方法,包括SVM,BAGSVM,随机森林和购物车到RNA-Seq数据。

作者:Gokmen Zararsiz,Dincer Goksuluk,Selcuk Korkmaz,Vahap Eldem,Izzet Parug Duru,Ahmet Ozturk,Ahmet Ergun Karaagaoglu

维护者:hotmail.com>的Gokmen Zararsiz

引用(从r内,输入引用(“ mlseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mlseq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ mlseq”)

PDF R脚本 “ MLSEQ”软件包的初学者指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 分类,,,,聚类,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 2.0.1
在生物导体中 Bioc 2.14(R-3.1)(5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 商在,,,,GGPLOT2
进口 方法,deseq2,,,,EDGER,,,,林玛,,,,生物酶,,,,总结性特征,,,,plyr,,,,foreach,utils,SSEQ,,,,Xtable
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,生物使用,,,,Venndiagram,,,,pamr
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 加尔斯
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 mlseq_2.0.1.tar.gz
Windows二进制 mlseq_2.0.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) mlseq_2.0.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mlseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/mlseq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/mlseq/
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