米拉
doi：10.18129/b9.bioc.mira
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅米拉。
基于甲基化调节活性的推断
生物导体版本：3.8
MIRA测量围绕感兴趣的调节位点（例如转录因子结合位点）的甲基化水平的“浸入”程度，以跨基因组进行该类型的位点的实例，然后可用于推断调节活性。
作者：内森·谢菲尔德
维护者：约翰·劳森（John Lawson）
引用（从r内，输入引用（“ Mira”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ mira”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Mira”）
| html | R脚本 | 将mira应用于生物学问题 |
| html | R脚本 | 从基于甲基化的调节活动推断开始 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | chipseq，，，，覆盖范围，，，，DNAMETHYLATY，，，，表观遗传学，，，，功能基因组学，，，，结肠管制，，，，基因数，，，，免疫学，，，，甲基，，，，测序，，，，软件，，，，系统生物学 |
| 版本 | 1.4.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（1。5年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 3.5） |
| 进口 | 生物基因，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机，，，，Data.Table，，，，GGPLOT2，，，，生物酶，统计BSSEQ， 方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特， 平行，测试，，，，生物使用，，，，rmarkDown，，，，AnnotationHub，，，，萝拉 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://databio.org/mira |
| BugReports | https://github.com/databio/mira |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 可可 |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | mira_1.4.1.tar.gz |
| Windows二进制 | mira_1.4.1.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | mira_1.4.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mira |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/mira |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/mira/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
