Logolas

DOI:10.18129 / B9.bioc.Logolas

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见Logolas．

具有字符串标识的EDLogo图和位置权重矩阵的自适应缩放

Bioconductor版本:3.8

生成标识图形，突出字符的丰富和减少，允许绘制字符串符号，并自适应地执行位置权重缩放，以及一些有趣的风格化。

作者:Kushal Dey [aut, cre]，谢东岳[aut]， Peter Carbonetto [ctb]， Matthew Stephens [aut]

维护者:Kushal Dey

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“Logolas”)

超文本标记语言	R脚本	引导标志教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，贝叶斯，SequenceMatching，软件，可视化
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(2年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.4)
进口	网格,SQUAREM，LaplacesDemon，统计，图形，utils，ggplot2，gridBase，Biostrings
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，Biobase，devtools，xtable，gridExtra，RColorBrewer，seqLogo，ggseqlogo
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kkdey/Logolas
BugReports	http://github.com/kkdey/Logolas/issues
全靠我
进口我
建议我	universalmotif
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	Logolas_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	Logolas_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Logolas_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Logolas
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Logolas
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Logolas/
软件包下载报告	下载数据