这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见林肯.
Bioconductor版本:3.8
该软件包提供了计算lincRNAs和蛋白质编码基因的共表达网络的方法。根据“关联有罪”方法,与蛋白质编码基因组相关的生物学术语可以预测lincRNAs的生物学背景。
作者:Manuel Goepferich, Carl Herrmann
维护者:Manuel Goepferich < Manuel。Goepferich在gmx.de>
引文(从R内,输入引用(林肯)
):
要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(林肯)
超文本标记语言 | R脚本 | LINC - lincRNAs共表达分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BiologicalQuestion,GeneExpression,GeneRegulation,软件 |
版本 | 1.10.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(2.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 3.3.1),方法,统计 |
进口 | Rcpp(> = 0.11.0)它,剂量,ggtree,gridExtra,猿、网格png,Biobase,股东价值分析,reshape2, utils, grDevices,org.Hs.eg.db,clusterProfiler,ggplot2,ReactomePA |
链接 | Rcpp |
建议 | RUnit,BiocGenerics,knitr,biomaRt |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | LINC_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | LINC_1.10.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | LINC_1.10.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LINC |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/LINC |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/LINC/ |
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