IVAS

doi:10.18129/b9.bioc.ivas

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅IVAS

鉴定影响替代剪接的遗传变异

生物导体版本:3.8

鉴定影响替代剪接的遗传变异。

作者:Seonggyun Han,Sangsoo Kim

维护者:Seonggyun Han 的Hamper>

引用(从r内,输入引用(“ ivas”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ivas”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

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Browsevignettes(“ Ivas”)

PDF R脚本 IVA:鉴定影响替代剪接的遗传变异
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 替代方案,,,,差异性,,,,差速器,,,,基因表达,,,,结肠管制,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,回归,,,,SNP,,,,测序,,,,软件,,,,转录
版本 2.2.1
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(4年)
执照 GPL-2
要看 R(> 3.0.0),GenomicFeatures,,,,GGPLOT2,,,,生物酶
进口 多帕尔,,,,LME4,,,,生物基因,,,,基因组机,,,,iranges,,,,foreach,,,,AnnotationDbi,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,Ggfortify,grdevices,方法,矩阵,,,,生物比较,utils,统计
链接
建议 生物使用
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源包 ivas_2.2.1.tar.gz
Windows二进制 ivas_2.2.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) ivas_2.2.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ivas
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ivas
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ivas/
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