HelloRanges

DOI:10.18129 / B9.bioc.HelloRanges

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅HelloRanges。

介绍* bedtools用户范围

Bioconductor版本:3.8

翻译bedtools命令行调用从Bioconductor * R代码调用函数范围基础设施。这是旨在培养新手Bioconductor用户和比较这两个框架的语法和语义。

作者:迈克尔•劳伦斯

维护人员:迈克尔·劳伦斯< michafla gene.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“HelloRanges”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“HelloRanges”)

PDF	R脚本	HelloRanges教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,报道,DataImport,GenomeAnnotation,SequenceMatching,测序,软件,VariantAnnotation
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(2.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	方法,BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.17.39),IRanges(> = 2.13.12),GenomicRanges(> = 1.31.10),Biostrings(> = 2.41.3),BSgenome,GenomicFeatures(> = 1.31.5),VariantAnnotation(> = 1.19.3),Rsamtools,GenomicAlignments(> = 1.15.7),rtracklayer(> = 1.33.8),GenomeInfoDb,SummarizedExperiment
进口	docopt、统计数据、工具、跑龙套
链接
建议	HelloRangesData,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	OMICsPCA
建议我	plyranges
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	HelloRanges_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	HelloRanges_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	HelloRanges_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HelloRanges
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HelloRanges
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HelloRanges/
包下载报告	下载数据