该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅htsfilter。
生物导体版本:3.8
该软件包实现了基于全局JACCARD相似性指数的复制转录组测序数据的过滤过程,以识别一个或多个实验条件下表达水平较低的基因。
作者:Andrea Rau,Melina Gallopin,Gilles Celeux和Florence Jaffrezic
维护者:Andrea rau
引用(从r内,输入引用(“ htsfilter”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ htsfilter”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ htsfilter”)
R脚本 | htsfilter小插图 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 差异性,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,正常化,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.22.1 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(6年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.4) |
进口 | EDGER(> = 3.9.14),deseq2(> = 1.10.1),deseq(> = 1.22.1),生物比较(> = 1.4.3),生物酶,utils,统计,grdevices,图形,方法 |
链接 | |
建议 | EDASEQ(> = 2.1.4),生物使用,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | Coseq |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | htsfilter_1.22.1.tar.gz |
Windows二进制 | htsfilter_1.22.1.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | htsfilter_1.22.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/htsfilter |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/htsfilter |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/htsfilter/ |
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