GeneExpressionSignature

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneExpressionSignature

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见GeneExpressionSignature

基于相似性度量的基因表达特征

Bioconductor版本:3.8

这个包给出了基因表达签名的实现及其与每个签名的距离。基因表达签名表示为其表达与感兴趣的生物状态相关的基因列表。使用基于Kolmogorov-Smirnov统计量的非参数、基于秩的模式匹配策略来定义它的距离。基因表达特征及其距离可用于检测药物、疾病和感兴趣的生物状态特征之间的相似性。

作者:曹阳

维护人员:曹阳在gmail.com> < yilu呵呵,李飞在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“GeneExpressionSignature”)):

安装

要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("GeneExpressionSignature")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GeneExpressionSignature”)

PDF R脚本 GeneExpressionSignature
PDF 参考手册

细节

biocViews GeneExpression软件
版本 1.28.0
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(7.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.13),BiobasePGSEA
进口
链接
建议 apclusterGEOquery
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 GeneExpressionSignature_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 GeneExpressionSignature_1.28.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) GeneExpressionSignature_1.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneExpressionSignature
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GeneExpressionSignature
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GeneExpressionSignature/
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