GSCA

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSCA

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GSCA。

GSCA:基因设置上下文分析

Bioconductor版本:3.8

GSCA需要列出作为输入的激活和抑制基因。GSCA然后搜索的公开的基因表达谱生物环境与指定的丰富的基因表达模式。GSCA提供传统R功能和交互,用户友好的用户界面。

作者:至诚,Hongkai霁

维护人员:至诚霁< zji4 jhu.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GSCA”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GSCA”)

PDF	R脚本	GSCA
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GUI,GeneExpression,软件,可视化
版本	2.12.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	闪亮的,sp,gplots,ggplot2,reshape2,RColorBrewer,rhdf5R (> = 2.10.0)
进口	图形
链接
建议	Affyhgu133aExpr,Affymoe4302Expr,Affyhgu133A2Expr,Affyhgu133Plus2Expr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GSCA_2.12.0.tar.gz
Windows二进制	GSCA_2.12.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GSCA_2.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSCA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GSCA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GSCA/
包下载报告	下载数据