GGtools

DOI:10.18129 / B9.bioc.GGtools

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GGtools。

软件和数据分析基因表达的基因

Bioconductor版本:3.8

软件和数据分析的遗传基因的表达和/或DNA甲基化

作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GGtools”)

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文档

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PDF	R脚本	GGtools: eQTL识别软件
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,软件
版本	5.18.0
Bioconductor自	BioC 1.9 (r - 2.4)(12.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.14),GGBase(> = 3.19.7),data.table平行,Homo.sapiens
进口	方法,跑龙套,统计数据,BiocGenerics(> = 0.25.1),snpStats,ff,Rsamtools,AnnotationDbi,Biobase,位,VariantAnnotation,hexbin,rtracklayer,Gvizstats4,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges(> = 1.29.6),迭代器,Biostrings,ROCR,biglm,ggplot2,reshape2
链接
建议	GGdata,illuminaHumanv1.db,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37,乘,大气气溶胶,rmeta
SystemRequirements
增强了	MatrixEQTL,foreach,doParallel,gwascat
URL
取决于我	ceu1kg,eQTL
进口我	ceuhm3,GeneGeneInteR
建议我	cgdv17,dsQTL,GGBase,gQTLBase,hmyriB36
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GGtools_5.18.0.tar.gz
Windows二进制	GGtools_5.18.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	GGtools_5.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GGtools
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GGtools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GGtools/
包下载报告	下载数据