地球

doi：10.18129/b9.bioc.geoquery

该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅地球。

从NCBI基因表达综合（GEO）获取数据

生物导体版本：3.8

NCBI基因表达综合（GEO）是微阵列数据的公共存储库。鉴于该资源的丰富性质和多样性，只想将生物导体工具应用于这些数据是很自然的。地球Query是地理和生物导体之间的桥梁。

作者：Sean Davis

维护者：sean davis

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ geoquery”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Geoquery”）

html	R脚本	使用地球
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DataImport，，，，微阵列，，，，Onechannel，，，，智者，，，，软件，，，，两通道
版本	2.50.5
在生物导体中	Bioc 1.8（R-2.3）（13年）
执照	GPL-2
要看	方法，生物酶
进口	httr，，，，readr（> = 1.3.1），XML2，，，，dplyr，，，，花花公子，，，，马格里特，，，，林玛
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，生物基因，，，，测试，，，，COVR
系统要求
增强
URL	https://github.com/seandavi/geoquery
BugReports	https://github.com/seandavi/geoquery/issues/new
取决于我	drugvsdisease，，，，染色比例样本，，，，deogetAdb，，，，GSE62944，，，，扫描
进口我	Beadarrayusecases，，，，Bigmelon，，，，chipxpress，，，，coexnet，，，，杂交，，，，埃加德，，，，GSEABENCHMARKER，，，，Macpet，，，，Minfi，，，，MOONLIGHTR，，，，phantasus，，，，叙事，，，，Sradb
建议我	呼吸道，，，，抗fofilesdata，，，，Aucell，，，，坎特克，，，，ctsge，，，，diffcoepp，，，，染料，，，，弯头，，，，繁殖，，，，fgsea，，，，geneexpressionsignation，，，，多lust，，，，多胎，，，，OMICSPRINT，，，，甲状旁腺，，，，路径上，，，，PGSEA，，，，ProstateCancerCamcap，，，，Prostatecancergrasso，，，，Prostatecancerstockholm，，，，Prostatecancertaylor，，，，ProstateCancerServarame，，，，regparallel，，，，RGSEA，，，，rnits，，，，runibic，，，，skewr，，，，TargetScore，，，，ZFPKM
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	geoquery_2.50.5.5.tar.gz
Windows二进制	geoquery_2.50.5.5
Mac OS X 10.11（El Capitan）	geoquery_2.50.5.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geoquery
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/地球
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/geoquery/
软件包下载报告	下载统计