Funchip

doi:10.18129/b9.bioc.funchip

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅Funchip

基于其形状的芯片序列的聚类和对齐

生物导体版本:3.8

芯片隔离峰的预处理和平滑以及对K均比对算法的有效实现以对其进行分类。

作者:爱丽丝·帕罗迪[AUT,CRE],Marco Morelli [AUT,CRE],Laura M. Sangalli [aut],Piercesare Secchi [Aut],Simone Vantini [aut]

维护者:Alice Parodi

引用(从r内,输入引用(“ funchip”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ funchip”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Funchip”)

PDF R脚本 Funchip简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 chipseq,,,,聚类,,,,软件,,,,统计信息
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(2。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.2),基因组机
进口 闪亮的,,,,FDA,,,,多帕尔,,,,基因组签名,,,,RCPP, 方法,foreach, 平行,GenomeInfodB,,,,rsamtools,grdevices,图形,统计信息,rcolorbrewer
链接 RCPP
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 funchip_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 funchip_1.8.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) funchip_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/funchip
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/funchip
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/funchip/
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