EpiDISH

DOI:10.18129 / B9.bioc.EpiDISH

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见EpiDISH．

样本内异质性的表观遗传学解剖

Bioconductor版本:3.8

EpiDISH是一个R包，用于推断样本中存在的先验已知细胞亚型的比例，代表这种细胞类型的混合物。推理通过三种方法之一进行(鲁棒部分相关- rpc，数字排序(CBS)，约束投影(CP))，由用户决定。

作者:Andrew E. Teschendorff ，郑世杰

维护者:Shijie Charles Zheng

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“EpiDISH”)

超文本标记语言	R脚本	样本内异质性的表观遗传解剖- R包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，DifferentialMethylation，表观遗传学，ImmunoOncology，MethylationArray，软件
版本	1.4.1
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(1.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.4)
进口	质量，e1071，quadprog
链接
建议	roxygen2，GEOquery，BiocStyle，knitr，rmarkdown，Biobase，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/sjczheng/EpiDISH
BugReports	https://github.com/sjczheng/EpiDISH/issues
全靠我
进口我
建议我	FlowSorted.Blood.EPIC
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	EpiDISH_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	EpiDISH_1.4.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	EpiDISH_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EpiDISH
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EpiDISH
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EpiDISH/
软件包下载报告	下载数据