该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅富集图。
生物导体版本:3.8
富集的热图是一种特殊的热图,可视化基因组信号在特定目标区域的富集。在这里,我们通过ComplexHeatMap软件包实现了丰富的热图。由于这种类型的热图只是一个普通的热图,但是在某些特殊设置的情况下,具有复杂Heatmap的功能,因此自定义热图并将其串联到热图列表中以显示不同数据源之间的对应性要容易得多。
作者:Zuguang Gu
维护者:Zuguang gu
引用(从r内,输入引用(“富集示意图”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ renricheDheatMap”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“富集”示意图)
html | R脚本 | 比较行排序方法 |
html | R脚本 | 制作丰富的热图 |
html | R脚本 | 可视化分类信号 |
html | R脚本 | 可视化路线图数据集中的全面关联 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,基因数,,,,测序,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.2(R-3.2)(3。5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
要看 | R(> = 3.1.2),方法,网格,复杂的图像(> = 1.15.2),基因组机 |
进口 | 矩阵,统计getoptlong,,,,RCPP,utils,Locfit,,,,循环(> = 0.4.1),iranges |
链接 | RCPP |
建议 | 测试(> = 0.3),尼特,,,,降价,,,,GeneFilter,,,,rcolorbrewer |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/jokergoo/enrichedheatmap |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | enricheDheatMap_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | enricheDheatMap_1.12.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | EnricheDheatMap_1.12.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/enrichedheatmap |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ronicheDheatMap |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/enrichedheatmap/ |
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