EnhancedVolcano

DOI:10.18129 / B9.bioc.EnhancedVolcano

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅EnhancedVolcano。

Publication-ready火山地块与增强色彩和标签

Bioconductor版本:3.8

火山块代表一个有用的方式想象微分表达式的结果分析。在这里,我们提出一个高度可配置的功能,产生publication-ready火山地块。EnhancedVolcano将试图满足尽可能多的记录名称在图窗口,从而避免“堵塞”情节的标签,否则无法阅读。

作者:凯文Blighe

维护人员:凯文Blighe <凯文在clinicalbioinformatics.co.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“EnhancedVolcano”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“EnhancedVolcano”)

HTML	R脚本	Publication-ready火山地块与增强色彩和标签
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,软件,转录
版本	1.0.1
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5.0),ggplot2,ggrepel
进口
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,knitr,DESeq2,pasilla,气道,gridExtra,magrittr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kevinblighe/EnhancedVolcano
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	EnhancedVolcano_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	EnhancedVolcano_1.0.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	EnhancedVolcano_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EnhancedVolcano
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ EnhancedVolcano
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EnhancedVolcano/
包下载报告	下载数据