ENCODExplorer

DOI:10.18129 / B9.bioc.ENCODExplorer

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见ENCODExplorer．

ENCODE元数据的编译

Bioconductor版本:3.8

这个包允许用户快速访问ENCODE项目文件元数据，并允许访问帮助函数来查询ENCODE rest api，下载ENCODE数据集并以SQLite格式保存数据库。

作者:Charles Joly Beauparlant < Charles。Joly-beauparlant at crchul. ulval .ca>，Audrey Lemacon , Louis Gendron Astrid-Louise Deschenes, and Arnaud Droit

维护者:Charles Joly Beauparlant < Charles。Joly-beauparlant at crchul. ulval .ca>

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ENCODExplorer")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ENCODExplorer”)

超文本标记语言	R脚本	数据更新
超文本标记语言	R脚本	数据库模型
超文本标记语言	R脚本	ENCODExplorer简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，基础设施，软件
版本	2.8.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(4年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.3)，闪亮的，DT，shinythemes
进口	工具,jsonlite平行,RCurl，tidyr，data.table，dplyr，stringr，stringi
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，knitr，旋度，httr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/CharlesJB/ENCODExplorer/issues
全靠我
进口我
建议我	TSRchitect
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ENCODExplorer_2.8.0.tar.gz
Windows二进制	ENCODExplorer_2.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ENCODExplorer_2.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ENCODExplorer
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ENCODExplorer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ENCODExplorer/
软件包下载报告	下载数据