DominoEffect

DOI:10.18129 / B9.bioc.DominoEffect

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DominoEffect。

识别和注释的蛋白质热点残基

Bioconductor版本:3.8

功能支持热点残基在蛋白质的识别和注释。这些个别氨基酸积累突变以更高的速度比周围地区。

作者:Marija Buljan和彼得Blattmann

维护人员:Marija Buljan < marija.buljan。2:gmail.com >,彼得Blattmann < Blattmann在imsb.biol.ethz.ch >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DominoEffect”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“DominoEffect”)

HTML	R脚本	装饰图案为DominoEffect包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐,蛋白质组学,SequenceMatching,软件,SomaticMutation
版本	1.2.1 "
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(1年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 3.5)
进口	biomaRt,data.table,跑龙套,统计数据,Biostrings,SummarizedExperiment,VariantAnnotation,AnnotationDbi,GenomeInfoDb,IRanges,GenomicRanges
链接
建议	knitr,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DominoEffect_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	DominoEffect_1.2.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	DominoEffect_1.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DominoEffect
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DominoEffect
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DominoEffect/
包下载报告	下载数据