DirichletMultinomial

DOI:10.18129 / B9.bioc.DirichletMultinomial

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见DirichletMultinomial

微生物组数据的dirichlet -多项式混合模型机器学习

Bioconductor版本:3.8

dirichlet -多项混合模型可用于描述微生物宏基因组数据的可变性。此包是最初由Holmes, Harris和Quince, 2012, PLoS ONE 7(2): 1-15提供的代码接口,如此包的手册页中进一步讨论的? dirichlet多项式。

作者:马丁·摩根<马丁。在roswellpark.org>

维护者:马丁·摩根<马丁。在roswellpark.org>

引文(从R内,输入引用(“DirichletMultinomial”)):

安装

要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install(" dirichlet多项")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“DirichletMultinomial”)

PDF R脚本 狄利克莱多项式简介
PDF 参考手册

细节

biocViews 分类聚类ImmunoOncology宏基因组微生物组测序软件
版本 1.24.1
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(6.5年)
许可证 LGPL-3
取决于 S4VectorsIRanges
进口 stats4、方法BiocGenerics
链接
建议 晶格平行,质量RColorBrewerxtable
SystemRequirements gsl
增强了
URL
全靠我
进口我 TFBSTools
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 DirichletMultinomial_1.24.1.tar.gz
Windows二进制 DirichletMultinomial_1.24.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) DirichletMultinomial_1.24.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DirichletMultinomial
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ dirichlet多项式
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/DirichletMultinomial/
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