DNAshapeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.DNAshapeR

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见DNAshapeR．

DNA形状特征的高通量预测

Bioconductor版本:3.8

DNAhapeR是一个R/BioConductor包，用于超快速、高通量的DNA形状特征预测。该软件包允许预测，可视化和编码DNA形状特征进行统计学习。

作者:Tsu-Pei Chiu和Federico Comoglio

维护人员:Tsu-Pei Chiu

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("DNAshapeR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DNAshapeR”)

超文本标记语言	R脚本	DNAshapeR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNA3DStructure，软件，StructuralPrediction
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.4)，GenomicRanges
进口	Rcpp(> = 0.12.1),Biostrings，字段
链接	Rcpp
建议	AnnotationHub，knitr，rmarkdown，testthat，BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，脱字符号
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DNAshapeR_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	DNAshapeR_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DNAshapeR_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNAshapeR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DNAshapeR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DNAshapeR/
软件包下载报告	下载数据