该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅DNACOPIGY。
生物导体版本:3.8
实现循环二进制分割(CBS)算法以段DNA拷贝数数据,并识别具有异常拷贝数的基因组区域。
作者:Venkatraman E. Seshan,Adam Olshen
维护者:MSKCC.org>的Venkatraman E. Seshan
引用(从r内,输入引用(“ Dnacopy”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ dnacopy”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Dnacopy”)
R脚本 | DNACOPIGY | |
参考手册 |
生物浏览 | 库务,,,,微阵列,,,,软件 |
版本 | 1.56.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 14年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | CGHCALL,,,,CGHMCR,,,,克隆性,,,,犯罪,,,,属属,,,,Snapcgh |
进口我 | adacgh2,,,,Aneufinder,,,,arraytv,,,,冠军,,,,CN.Farms,,,,cnanorm,,,,CNVRD2,,,,contibait,,,,Conumee,,,,copywriter,,,,Gwastools,,,,MDTS,,,,Medips,,,,最小值,,,,QDNASEQ,,,,RCGH,,,,repitools,,,,芝麻,,,,Snapcgh |
建议我 | Beadarraysnp,,,,CN. -ops,,,,fastseg,,,,Genoset |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | dnacopy_1.56.0.tar.gz |
Windows二进制 | dnacopy_1.56.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | dnacopy_1.56.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dnacopy |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/dnacopy |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dnacopy/ |
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